FIJI-Plugin für IKOSA-Plattform
Masterprojekt
Die IKOSA-Plattform der KML Vision GmbH bietet ein breites Portfolio von KI-basierten Algorithmen für verschiedene Bildanalysen im Life Science Bereich. Die OSS (Open-Source-Software) ImageJ beziehungsweise FIJI findet in diesem Bereich breite Anwendung für bildbasierte Analysten.
Ziele
Ziel des Projekts war es, das bestehende IKOSA-Plugin für Fiji / ImageJ um folgende Funktionen zu erweitern, welche die Analysen mit IKOSA effizienter und user:innenfreundlicher machen:
- Auswahl von bestimmten Bildbereichen, den sogenannten „Regions of Interest“ (ROIs) in Fiji, um darauf gezielte IKOSA-Analysen zu starten
- Visualisierung von Analyseresultaten verschiedenster Formate direkt in Fiji
Ergebnis
Das IKOSA FIJI-Plugin wurde um die Funktionalität der ROI-Analyse erweitert. Zudem wurde eine Funktionalität entwickelt, um die Analyseresultate direkt im Plugin anzeigen zu können. Die ROI-Analyse ermöglicht die Vorbereitung von Daten für die Entwicklung weiterer Bildanalyse-Algorithmen in IKOSA.
IKOSA Plugin, ROI Auswahl und ROI Manager (© FH JOANNEUM / eHealth)
Auswahl des ZIP-Verzeichnisses in IKOSA (© FH JOANNEUM / eHealth)